«Методы исследования единичных биологических молекул»
Преподаватель – к.б.н. Б.А.Фенюк
С 10 февраля в 9.00, ауд.410
В экспериментальных методах классической химии, биохимии и биофизики наблюдения проводятся на системе, состоящей из огромного числа молекул. Получаемые данные характеризуют усредненные свойства молекул изучаемой системы. При этом из-за усреднения теряется значительная часть информации. (Простой пример: для наборов чисел 2, 5, 5 и 0, 4, 8 среднее значение одинаково и равно 4.)
В живом организме важные реакции, регулирующие жизнедеятельность, протекают именно между отдельными молекулами – ДНК и ДНК-полимеразой, миозином и актином, антителом и антигеном, рецептором и лигандом. Для биологических макромолекул, которые в ходе выполнения своей роли переходят из одного функционального состояния в другое, зачастую невозможно выяснить классическими методами ни количество этих состояний, ни последовательность перехода из одного в другое, ни время жизни каждого состояния. Методы изучения единичных молекул позволяют решить эту задачу.
В последние годы все больше и больше новых экспериментальных данных в биологии дает изучение свойств и межмолекулярного взаимодействия отдельных биологических молекул. Данный курс кратко освещает историю и общие принципы таких методов изучения единичных молекул, как флуоресцентная микроскопия (конфокальная и TIRF-микроскопия), атомная силовая микроскопия, криоэлектронная микроскопия и др. Для каждого метода разбираются его сильные и слабые стороны, возможности и ограничения. Кроме того, приводятся примеры использования этих методов для получения информации, недоступной при использовании классических методов исследования.
«Моделирование в системной биологии и его применение в биотехнологии и биомедицине»
Преподаватель – к.ф.-м.н. О.В.Демин
С 10 февраля в 15.35, ауд.122
В рамках курса будут кратко изложены основные принципы построения и верификации математических моделей биологических систем, таких как ферментативные реакции, метаболические и сигнальные пути, пути клеточной динамики.
Будут рассмотрены основные принципы, лежащие в основе построения математических моделей, описывающих изменение концентрации лекарства в организме (фармакокинетика) и его взаимодействия с белком – мишенью.
Курс построен на примерах использования различных методов моделирования для решения задач биомедицины и фармакологии. Предполагается проведение практических занятий с использованием специализированного программного обеспечения (DBSolveOptimum).
«Дополнительные главы биоинформатики»
С 13 февраля в 15.35, ауд.207
|
Возможны корректировки расписания, следите за объявлениями! | ||||
|
Месяц |
Число |
№ |
Преподаватели |
Блок |
|---|---|---|---|---|
| Февраль | 13 | 1 | Макеев В.Ю. | Статистика слов в геномах. |
| Февраль | 20 | 2 | Макеев В.Ю. | |
| Февраль | 27 | 3 | Макеев В.Ю. | Chip-sequencing — метод определения сайтов связывания белков с ДНК: технология, обработка результатов. |
| Март | 5 | 4 | Никулова А.А. | Поиск регуляторных сайтов в геномах эукариот |
| Март | 12 | 5 | Алексеевский А.В. | Секвенатор Illumina: технология, что на выходе, ошибки метода. Алгоритмы сборки геномов из коротких ридов. Программы. |
| Март | 19 | 6 | Алексеевский А.В. | |
| Апрель | 2 | 7 | Сутормин Р.А. | Аннотация геномов. Подходы и программы |
| Апрель | 9 | 8 | Будет объявлено дополнительно. | |
| Апрель | 16 | 9 | Карягина А.С. | Экспрессионные чипы: технология, ошибки, обработка результатов, примеры. |
| Апрель | 23 | 10 | Карягина А.С. | |
| Апрель | конец апреля | Серебрякова М.В. | Основы масс-спектрометрии. Отдельный миникурс из двух лекции и практического занятия в компьютерном классе. | |
| Апрель | Серебрякова М.В., Курдюкова Л.В. | |||
| Май | 7 | 11 | Певзнер П.А. | Алгоритмы обработки данных масс-спектромерии |
| Май | 14 | 12 | Резерв | |
| Май | 21 | Зачёт | ||
